前回記事では，糖尿病患者と健常人とでは，腸内細菌の様相がかなり異なることを紹介しました．
特に注目されるのは，欧州と中国で独立に行われた調査で，人種はまったく異なるにもかかわらず；
- 短鎖脂肪酸(酪酸)を産生する菌が，糖尿病では少ない
- 通常 正常な腸内ではもっとも豊富なF. prauznitzii菌が，糖尿病の人では少ない
と共通していたことです．ただし，調査対象に投薬者が含まれていたので，その影響があったのかまでは不明です．
ところで 前回のシリーズでは，
腸にはメトホルミン [1][2][3][4][5][6][7][8]
肝臓・血管に吸収されなかったメトホルミンは，無為に体外に捨てられていたのではなく，実は腸壁に長時間留まって血糖値を下げる働きをしている
このことが，最近 世界の学界の注目を集めていることを紹介しました．そうだとすれば；
メトホルミンは腸内細菌に影響するのか
まず影響しないわけがなかろう，というのが 第一印象ですね． 実際そこに着目した報告が最近 多くなっています．
対象者
調査対象者は，南米 コロンビア共和国の都市住民です． 基本データは以下の通り．
糖尿病の対象者は，当然ですが 糖尿病でメトホルミンを服用している人は，薬はそれだけとは限りません．この報文の補足データ を見ると，インスリンや，スタチン，降圧薬が多いです． また 糖尿病だが メトホルミンを服用していない人を見ると，一切 服用薬なしという人が14人中4人います． さらに糖尿病ではない人(対象群)でも84人中60人はまったく薬を服用していませんでしたが，24人は薬(主にスタチン，降圧薬)を服用していました．したがって，この研究は 服薬の影響を完全には回避できていません．
結果
細菌の系統樹分類
原文には 『検出された 各腸内細菌のDNAを16sリボゾームRNA法で分類し，これを Unifracにより系統の近いものをMappingした』とありますが，細菌学に無知の私には何のことやら．しかし調べてみると『16sリボゾームRNA遺伝子配列』決定については，信州大学 川上由行先生の完璧な説明がありました．
『バクテリアの“16sリボゾームRNA”って, なに???』
これでも難解ですが，つまりは細胞DNAの『分子時計』を利用して，細菌の時系列進化情報が得られる，つまりどの細菌がどの祖先から分かれて進化したのかという『系統樹』情報が得られる方法のようです．
系統樹といえば
系統樹と言えば，細菌だけでなくウイルスにも系統樹はあります．最近 大騒ぎになっている 新型コロナウイルスは下のように；
以前流行したSARSやMERSウイルスとは，親戚関係です． ただし図の通り，新型コロナウイルスはSARSとはいとこのような『近縁』ですが，MERSとはひい爺さんが共通くらいの『遠い親戚』にあたります．
糖尿病における腸内細菌の分類結果
そこで，複数の細菌が 系統樹において，どれくらい近いかor遠いかを表したのが下の図です．検出された腸内細菌のゲノムを調べて，それぞれを 細菌系統樹に配置した時，互いにどれくらい離れているのかを表したものです．
腸内の細菌がバラエティーに富んでいれば大きな放射円になります． 反対に特定の系統の細菌ばかりであれば，小さなかたまりになってしまいます．
まず注目されるのは，糖尿病でない人(ND；青)に比べて，糖尿病だがメトホルミンを服用していない人(T2D-Met-；赤)は，明らかに腸内細菌の種類が少ない，つまり多様性が失われています．それに対してメトホルミンを服用している人 (T2D-Met+；黄)は，細菌の種類が増えていることがわかります． ただし，その形はNDと同じではありません．したがって，メトホルミン服用でおなかの調子が悪くなる人は，こういうところに原因があるのかもしれません．
[3]に続く
Source: しらねのぞるばの暴言ブログ
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