糖尿病と遺伝[7] 本命は未踏領域に?

健康法

ありふれた遺伝子変異

ヒトのゲノム全解析が進むにつれて,多数の『糖尿病に関連する遺伝子』が発見されてきたのに,それらをすべて合わせても 実際の糖尿病の遺伝率=30%の内,10%程度しか説明できない
これは 古典的遺伝学者だけでなく,分子遺伝学者にとっても『悪夢;Nightmare』でした.糖尿病の遺伝は DNA全解析によって解決する問題と思われていたからです.

ゲノム情報から糖尿病の遺伝原因を探索する方法は,糖尿病の人と正常人の間で それぞれDNA全体からSNP(★)を単純比較して,糖尿病の人に有意に多い変異があれば,それを『糖尿病に関連する遺伝子』というものです.たしかにこれでゾロゾロと見つかりました.しかしこれらは『ありふれた』『よく見られる』変異です.多い場合では,10人中4人がそのような変異を持っていることも珍しくありません.それらは糖尿病の人にも,糖尿病でない正常な人にも比較的多くみられるものであり,ただ糖尿病の人の方により多くみられたというだけです.そういう遺伝子を持っていれば必ず糖尿病になり,持っていなければ絶対に糖尿病にならない,というわけではありません.

(★)SNP = Single Nucleotide Polymorphism; 一塩基多型
たとえば 正常なDNAの塩基配列がこうだったとして,

その中の1つだけが他の塩基に変わっていれば,ここに SNPがあることになります.
多くの場合,このような小さな変異があっても,DNAの機能には支障は起こらず,外的形質には変化は生じません.

非常に稀な遺伝子

そういう『ありふれた』変異とは対照的なのが,以前にも触れたMODYの遺伝子です.この遺伝子に変異があれば,100%MODYになり,持っていなければ 絶対にMODYになりません.

発見頻度と遺伝率

ここで;

縦軸=遺伝率(遺伝因子による発症効果の強度)
横軸=集団で見出される頻度

として,現在知られている 糖尿病の遺伝子をプロットするとこうなります.

MODYは非常に稀ですが(=1~数万人に一人),それを持っていれば確実にMODYが発症します[図;左上].

逆に 今までに発見されている『2型糖尿病に関連する遺伝子変異』は,珍しいものではなく,極端な場合は3人に1人くらいにみられます.そしてそれらを持っている人と持っていない人とを比べても,糖尿病の有病率にはほとんど差がありません[図;右下].

未踏の領域

ということは,このグラフのぽっかりと空いている領域に,実は 本当に『糖尿病発症を左右する遺伝子』が存在するのではないか,という疑問は当然わくでしょう.

もしもこの領域に遺伝子が見つかれば,それはこうなるだろうと期待されます.

これであれば,糖尿病の予測に使えるし,何より 『家族糖尿病遺伝率~30%を説明できない』という問題にも解答が得られます.

発見は困難

ただし,これも確証があってのことではなくて,まだ調べられていない領域があるから,正解はそこにあるのかもしれない(あってほしい)というだけです.
山師が まだ掘っていない山を見て,『あそこにこそ金鉱脈があるのかも』と思う心理と同じです.

しかも,今までの話から当然予測されるように,このような遺伝子の発見は非常に困難です.より大規模に,かつより詳細にヒトゲノム解析を行わねばなりません.

実際このアプローチを行ってみた報告もありますが;

(C) Nature

期待通りの遺伝子は 発見できなかったようです.
もちろん『存在しない』という証明は不可能ですので,ある日突然発見されるのかもしれませんが.

[8]に続く

Source: しらねのぞるばの暴言ブログ

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